Produkty
Producenci

ClaSeek NGS Kit Illumina

nr kat.: K1341
Opakowanie: 12 reak.
Cena brutto: do wyceny
ilość szt.

towar niedostępny

dodaj do przechowalni

Opis

Thermo Scientific ClaSeek Library Preparation Kit, kompatybilny z systemem Illumina™ został zaprojektowany do szybkiej i wygodnej konstrukcji bibliotek fragmentów NGS bez uzycia PCR. Zestaw umożliwia tworzenie bibliotek nawet z niewielkich próbek DNA – 500 ng, a w połączeniu z protokołem amplifikacji nawet z 5 ng próbki.


Zestaw wykorzystuje wysoce wydajny protokół konstrukcji zoptymalizowanych bibliotek do NGS łączący 2 etapy konwersji końców oraz dodawanie adapterów w jedną procedurę. Dzięki temu wyeliminowano niepotrzebne etapy pipetowania oraz ograniczono czas pracy użytkownika do 70 min.  Zestaw jest odpowiedni do konstrukcji bibliotek fragmentów o długościach 50, 300 oraz 500 pz.

 

Technika ClaSeek oparta jest o ligację do końców DNA adapterów sekwencjonowania. Końce 5’ oraz 3’ fragmentów DNA poddaje się konwersji w następujący sposób: 5’ – tępienie i fosforylacja; 3’ -  dodanie  wiszących końców - w zależności od platformy sprzętowej mogą być dodane  np. dA. W kolejnym etapie następuje ligacja adapterów do skonwertowanych końców.

System jest zwalidowany do użycia w systemach Illumina™ HiSeq™ oraz MiSeq™.

 

Właściwości

  • Bez reakcji PCR – znacząco eliminuje możliwe odchylenia związane z reakcją PCR, co pozwala na uzyskanie bardziej wiarygodnych wyników sekwencjonowania.
  • Elastyczny – uniwersalny protokół dla różnych wielkości próbek (5 ng – 1 µg) oraz długości fragmentów.
  • Szybki i wygodny – mniej etapów oczyszczania, krótszy czas pracy z próbką zoptymalizowany mastermix oraz procedura konwersji końców w jednej probówce.

 
Zastosowanie

  • Przygotowanie biblioteki fragmentów DNA do dalszej analizy Next Generation Sequencing.

 

Skład zestawu

  • ClaSeek End Conversion Master Mix, IL
  • ClaSeek Ligation Mix, IL
  • Woda wolna od nukleaz

 

Fragmenty DNA z genomu E. coli przygotowane z różnej ilości DNA przy użyciu sytemu Illumina™ oraz zestawów Thermo Scientific ClaSeek Library Preparation Kit zgodnie z zaleceniami producenta (8-10 cykli). Selekcję fragmentów 300 pz wykonano przy pomocy MagJET NGS Cleanup and Size Selection Kit. Stworzone biblioteki przeanalizowano na aparacie Agilent Bioanalyzer 2100™ przy użyciu zestawu High Sensitivity DNA Kit™ (Life Technologies Inc.). 

 

 
Pocięte gDNA z próbek E. coli (50 ng każdej) zostały poddane konwersji końcówek zgodnie z protokołem. Trzy grupy różnej długości fragmentów DNA zostały wyselekcjonowane, a następnie przeprowadzono amplifikację praz oczyszczanie za pomocą zestawów MagJET. Stworzone biblioteki przeanalizowano na aparacie Agilent Bioanalyzer 2100™ (Life Technologies Inc.). 

Dane techniczne

Opakowanie 12 reak.

Pliki do pobrania

Produkty powiązane

do góry
Sklep jest w trybie podglądu
Pokaż pełną wersję strony
Sklep internetowy Shoper.pl